Задания |
| 0) Вводное занятие: проверка подключения и средств связи. |
| 1) Платформа аренды вычислительных мощностей Yandex Cloud. |
| 2) Основы удаленного доступа: протоколы RDP и SSH |
| 3) Передача файлов на удаленные машины: протоколы SFTP и SCP, утилита winSCP |
| 4) Коллоквиум: устный опрос по пройденному материалу |
| 5) Визуализация молекул, функционал приложений: PyMol |
| 6) AlphaFold3. Принципы работы. Оценка качества моделирования. Сравнение с PDB |
| 7) Возможности AlphaFold3 в области моделирования комплексов белок-лиганд |
| 8) Коллоквиум: устный опрос по пройденному материалу |
| 9) Молекулярное моделирование. Молекулярная динамика. Применение методов молекулярной динамики в пакете GROMACS |
| 10) Молекулярная динамика белок-лигандного комплекса |
| 11) Обзор статей по применению AlphaFold3 для задач биотехнологий и биомедицины |
| 12) Консультация перед экзаменом |
| 13) Экзамен |