Задания |
0) Знакомство в Zoom. Вход в Gather, расшаривание экрана, общий пайплайн антимикробных пептидов. |
1) Работа с облаком: вход, запуск/остановка, изменение типа ВМ. |
2) Подключение к виртуальной машины на Яндекс-клауд (при помощи PyTTY и winSCP). |
3) AlphaFold3. Создание модели пептида. |
4) Pymol: Смотрим результаты AlphaFold3. |
5) Gromacs: подготовка и сольватация. Баланс ионов. |
6) Молекулярная динамика Gromacs |